2013年下半年，臺州市港航管理局統籌安排，啟動《臺州港總體規劃》修訂工作。此次港口總體規劃調整的總體思路是積極呼應浙江省海洋經濟發展示范區國家戰略的要求，打造“一核、兩翼、三圈、九區、多島”布局的海洋經濟發展大平臺中的“兩翼”中的南翼和“九區”之一的臺州灣循環經濟產業集聚區建設；呼應長三角發展戰略，積極融入長三角港口的發展；呼應浙江沿海產業帶的發展，服務于臺州沿海產業帶的建設；呼應“三位一體”港航物流服務體系的布局，加快推進體系規劃中臺州項目的建設，提升臺州港口綜合服務能力。

《臺州港總體規劃》突出以臨海頭門港區為主體，海門港區、黃礁大陳石化作業區等組成的臺州灣中心港區的建設，拓展大麥嶼港區、健跳港區為兩翼，統籌建設溫嶺龍門、黃巖港區、臨海內江作業區等多點并舉、齊頭并進的港口建設格局，使臺州港口的建設形成重點突出、功能明確、錯位發展的良好局面。規劃修訂重點達到新增黃礁港區，提升臨海頭門港區、大麥嶼港區部分岸線資源，調整海門港區部分岸線功能，并進一步明確臺州港港界范圍，使港口規劃服務于港口經濟和地方國民經濟，促進臺州海洋經濟的快速發展。